Если вы используете svn, то при переносе проекта на хостинг вам понадобится очистить дерево проекта от служебных файлов. SVN сохраняет свои служебные файлы в директориях .svn по всему проекту. Для того чтобы удалить все директории .svn нужно выполнить следующие команды:
cd /var/www/projectfind . -name .svn -exec rm -R {} \; -print
Я рекомендую выполнять удаление служебных файлов из копии проекта, если вы не уверены на 100% что не будете использовать svn в дальнейшем.